福州市商业银行成立于1996年12月27日，是经福州市政府同意，由中国人民银行总行批准，在福州市原14家城市信用社和城市信用社联社的基础上，由地方财政、企业法人和个人共同参股组建，具有独立法人资格的福州市第一家地方性股份制商业银行，下辖29家支行和一个总行营业部，实行“总行—支行”扁平式经营管理模式。

至2006年末，福州市商业银行本外币资产总额为223.61亿元，比年初增加87.18亿元，增长63.9%，是成立时的近10倍；本外币各项存款余额为190.20亿元，比年初增加 76.21亿元，增长66.89%，是成立时的近12倍；本外币各项贷款余额为118.50亿元，比年初增加46.10亿元，增长63.66%，是成立时的近14倍；存贷比为48.10%；五级分类不良资产率为2.19%，比年初下降了1.46个百分点；不良贷款率为2.92%，比年初下降了2.54个百分点，较年度计划低2.08个百分点，实现“双降”；全年实现账面利润2.75亿元，同比增加2.06亿元，增长298.6%，完成年度计划的183.30%。

福州市商业银行先后于2003年6月、2004年8月、2005年6月在民营经济发达、外向型经济活跃、中小企业密集的长乐市、连江县和福清市设立了分支机构，进行网点布局的科学规划和网点资源合理配置，进一步细化金融市场。

2007年5月27日，该行经福建省银监局批准同意，在长乐市金峰镇正式设立支行。